Den svenska kusten ligger bara cirka 65 kilometer från Skagen. Att svenskar kommer till Skagen är inget nytt fenomen, men det har skett i många olika syften under årens lopp. Historien berättar att svenska trupper nådde Skagen den 20 januari 1644.

Under århundraden har många svenska målare rest till Skagen för att måla i det speciella och starka ljus som finns här. Efter att hamnen öppnades 1907 började många svenska fiskare att vallfärda till Skagen. 

På västkusten av Sverige var fiskeindustrin inte särskilt utbredd, så när den utvecklades i Skagen hittade allt fler svenska fiskare till Skagens hamn. De många svenska träkuttrarna var en vacker syn när de anlände till hamnen. 

Ofta var fiskebåtarna tvungna att stanna i hamnen flera dagar på grund av vädret, och med de många svenska fiskarna i staden uppstod det ibland slagsmål mellan de danska och svenska fiskarna. 

Många av de svenska fiskarna på västkusten var starkt troende, och när det var sön- och helgdag fiskade de inte. Det gjorde däremot de danska fiskarna, så fruar och flickvänner blev kvar i stan med de många svenskarna. 

Det orsakade ibland problem när de blev lite för vänliga mot de svenska fiskarna.

I Skagen anställdes en svensk präst som kunde hålla gudstjänster för svenskarna på deras eget språk i den danska kyrkan. Men det var inte som om det var deras egen kyrka. Behovet av att bilda en invandrarförsamling växte. 

Det fanns ett behov av en plats där svenskarna kunde känna sig mer hemma än i den danska kyrkan. En plats där de kunde träffa sina landsmän och bilda nätverk. Gustaf Ljungmann, en svensk arkitekt, ritade en kyrka som byggdes under överinseende av Ulrik Plesner. 

År 1925 stod den svenska sjömanskyrkan i Skagen färdig. Förutom kyrksalen innehöll den också ett bibliotek och ett kafferum. Nu finns även en flygel med rum i anslutning. 

Kyrkan har genom åren varit en samlingsplats för många svenska fiskare som kom till Skagen och behövde någonstans att bo. Men även turister från Sverige och många andra länder samt Skagenbor har hittat till kyrkan, där det genom åren har druckits mycket kaffe och ätits "kanelbullar" och "smörgåsar" i det intilliggande kafferummet.